舰船的选择直接影响战斗效率和资源投入回报。综合性能最强的战舰当属康斯但丁大帝级综合战列巡洋舰，其定位为中排输出核心，搭载脉冲炮和重型能量导弹系统，改造空间大且防御能力优秀，但获取和升级成本较高。航母方面，太阳鲸武装战略航空母舰凭借均衡属性和战略价值成为舰队核心，尤其在搭载舰载机后能显著提升整体火力覆盖范围。
巡洋舰中表现突出的是卡利斯托级和奇美拉级。前者依靠重型鱼雷系统对大型目标造成毁灭性打击，但防御较弱；后者被称为小战巡，基础属性在同类舰船中位列前三，输出能力稳定。艾奥级攻坚离子炮巡洋舰作为稀有的能量武器舰船，免费获取且强化空间大，性价比极高。猎兵级重型舰载机巡洋舰虽自身火力不足，但仅需18指挥值即可搭载4艘护航艇，战术灵活性极强。
苔原级和谷神级凭借支援能力成为编队常客，前者维修效率突出，后者搭配舰载机可形成复合战术。斗牛级脉冲炮驱逐舰前期优势明显，能量武器能有效克制护甲单位。枪骑兵级轻型导弹驱逐舰则以低指挥值消耗和均衡火力著称，适合作为过渡期主力。需注意驱逐舰普遍生存能力有限，需配合护卫舰或巡洋舰协同作战。
护卫舰作为基础作战单位，红宝石离子炮型凭借能量伤害机制成为对抗大型舰船的特化选择，刺水母级则是通用性代表。雷利亚特级隐身型和战术型分别擅长生存与爆发输出，而澄海级重型护卫舰在满级后能通过集火机制实现短时高伤。这类舰船成本低但战略价值不可忽视，尤其在前期资源紧张阶段可作为核心战力培养。
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